Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mcmdc2E9Q956 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcmdc2E9Q956 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcmdc2E9Q956 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcmdc2E9Q956 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcmdc2E9Q956 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcmdc2E9Q956 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcmdc2E9Q956 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcmdc2E9Q956 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcmdc2E9Q956 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcmdc2E9Q956 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcmdc2E9Q956 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms