Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col22a1E9Q7P1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms