Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430401F13RikE9Q328 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms