Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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