Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms