Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI7

C87414, Expressed sequence C87414, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87414E9PWI7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C87414E9PWI7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C87414E9PWI7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C87414E9PWI7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms