Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FgaE9PV24 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FgaE9PV24 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms