Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms