Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptprz1B9EKR1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms