Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Polr3aB2RXC6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr3aB2RXC6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms