Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26c1B2RXA7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms