Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700018F24RikB2RW27 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms