Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms