Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms