Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apol7aB2RT54 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol7aB2RT54 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms