Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp36B1AQJ2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms