Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms