Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc38A3KMP2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc38A3KMP2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc38A3KMP2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc38A3KMP2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc38A3KMP2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc38A3KMP2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc38A3KMP2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms