Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms