Protein–RNA interactions for Protein: A2ALC6

Gm4985, MCG8129, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4985A2ALC6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm4985A2ALC6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm4985A2ALC6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms