Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms