Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700023F06RikA2AB62 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700023F06RikA2AB62 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms