Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87977A2A958 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87977A2A958 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87977A2A958 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87977A2A958 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C87977A2A958 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C87977A2A958 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87977A2A958 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87977A2A958 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms