Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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Prdm16A2A935 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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Prdm16A2A935 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm16A2A935 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm16A2A935 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
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