Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprfA2A8L5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms