Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam71e1A1L3C1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms