Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms