Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn2aA0A0J9YTW6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn2aA0A0J9YTW6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn2aA0A0J9YTW6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn2aA0A0J9YTW6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn2aA0A0J9YTW6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn2aA0A0J9YTW6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn2aA0A0J9YTW6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms