Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ednrb-202ENSMUST00000172237 3989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ccdc162-201ENSMUST00000019955 1891 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm15477-202ENSMUST00000143945 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Stam-201ENSMUST00000028050 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 St5-202ENSMUST00000079282 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm38275-201ENSMUST00000193293 1532 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Srpx2-202ENSMUST00000113304 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm44284-201ENSMUST00000203836 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Stxbp5l-205ENSMUST00000114782 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fam32a-201ENSMUST00000003123 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 2810407A14Rik-202ENSMUST00000189929 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm45139-201ENSMUST00000206543 2057 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 2610008E11Rik-201ENSMUST00000039271 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gzmg-201ENSMUST00000015578 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm28177-201ENSMUST00000185516 3532 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Flad1-201ENSMUST00000050398 3007 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Trim17-202ENSMUST00000075141 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zmym3-203ENSMUST00000117901 5178 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Lrrc18-201ENSMUST00000038956 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Acsl6-205ENSMUST00000094194 2554 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nek10-202ENSMUST00000112630 3348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rpap3-ps2-201ENSMUST00000184741 2161 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms