Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm37350-201ENSMUST00000192782 313 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 BC030343-201ENSMUST00000199606 2439 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 4930556L07Rik-201ENSMUST00000134422 1490 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Arid3b-201ENSMUST00000004780 3785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm36426-201ENSMUST00000222903 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Trim9-201ENSMUST00000110520 4156 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 A230056P14Rik-201ENSMUST00000130189 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Plekhs1-202ENSMUST00000178590 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Plekhs1-201ENSMUST00000039666 2378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Kif16b-203ENSMUST00000211861 4523 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Zfp189-201ENSMUST00000042964 2835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Zcchc12-204ENSMUST00000115258 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Foxp2-205ENSMUST00000115474 2544 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Parpbp-201ENSMUST00000048518 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm37459-201ENSMUST00000192259 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Sez6l2-202ENSMUST00000106333 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Ankrd6-205ENSMUST00000108166 2321 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Fancb-203ENSMUST00000167446 2953 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Apol7b-201ENSMUST00000089469 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms