Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Olfr312-201ENSMUST00000078217 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC123619.1-203ENSMUST00000225276 2757 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Prkar1a-203ENSMUST00000106677 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tmem144-202ENSMUST00000168038 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Myo1g-201ENSMUST00000003459 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mill2-205ENSMUST00000227379 1998 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Agxt2-201ENSMUST00000022858 1825 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cnbd2-203ENSMUST00000109580 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Lyn-202ENSMUST00000103010 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 9330121K16Rik-201ENSMUST00000211464 3886 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms