Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AL662807.2-201ENSMUST00000224024 3335 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Piwil4-201ENSMUST00000076946 2637 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Dennd1b-202ENSMUST00000168527 8206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rasgrf1-203ENSMUST00000189545 4766 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm42907-201ENSMUST00000199793 2148 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Unc45b-205ENSMUST00000164945 3555 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm16630-201ENSMUST00000180741 3257 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Smoc1-203ENSMUST00000129362 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Apol11b-201ENSMUST00000166623 2057 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Itgb6-201ENSMUST00000028348 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Osbpl9-218ENSMUST00000162787 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms