Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

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Length 1,482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm10577-201ENSMUST00000097954 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 AC140299.1-201ENSMUST00000217855 1510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Ighv1-7-201ENSMUST00000103496 388 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Calhm1-201ENSMUST00000111813 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Tmsb15a-202ENSMUST00000113154 544 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm11223-201ENSMUST00000120560 450 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 1700049E15Rik-202ENSMUST00000152737 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Grin2bQ01097 Ear6-202ENSMUST00000169070 893 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Grin2bQ01097 Gm21919-201ENSMUST00000185653 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Scgb1b11-201ENSMUST00000186031 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Grin2bQ01097 Gm21824-201ENSMUST00000186810 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm21862-201ENSMUST00000186957 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm21796-201ENSMUST00000187116 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm21795-201ENSMUST00000187263 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm28814-201ENSMUST00000187334 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm21720-201ENSMUST00000187428 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Grin2bQ01097 Gm21895-201ENSMUST00000189997 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Grin2bQ01097 Scgb1b18-201ENSMUST00000191255 402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Grin2bQ01097 Sat2-201ENSMUST00000092969 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Grin2bQ01097 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm8257-201ENSMUST00000111860 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Slc25a14-202ENSMUST00000114936 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Igkv4-86-201ENSMUST00000103337 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Grin2bQ01097 Olfr409-ps1-201ENSMUST00000118809 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Vmn1r-ps114-201ENSMUST00000121050 1040 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms