Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gas2-209ENSMUST00000208711 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm18638-201ENSMUST00000211293 1773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Olfr1283-203ENSMUST00000216637 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm38148-201ENSMUST00000195166 3012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm12353-201ENSMUST00000108250 554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm14439-201ENSMUST00000122320 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm24013-201ENSMUST00000157727 99 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm27203-201ENSMUST00000183677 307 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 2010009K17Rik-201ENSMUST00000186977 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm11567-201ENSMUST00000078442 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Sez6l-203ENSMUST00000197425 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 9130015G15Rik-201ENSMUST00000208621 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Cnga3-204ENSMUST00000195272 2197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Phyhd1-203ENSMUST00000113643 1195 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm15104-201ENSMUST00000132626 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 1700112D23Rik-201ENSMUST00000167704 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 4921509A06Rik-201ENSMUST00000171278 392 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm4929-201ENSMUST00000182021 992 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 D830044I16Rik-205ENSMUST00000206296 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm45047-201ENSMUST00000207651 309 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm18339-201ENSMUST00000218074 888 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Pvt1-201ENSMUST00000180432 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Snx6-204ENSMUST00000218934 1441 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Rpl7l1-ps1-201ENSMUST00000118822 725 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm5550-201ENSMUST00000198658 1076 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm44576-201ENSMUST00000208876 411 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm45566-201ENSMUST00000209883 1168 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 AC165159.2-201ENSMUST00000224080 441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 P2rx2-206ENSMUST00000200214 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 AC140393.1-201ENSMUST00000227959 1581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 4933427I22Rik-202ENSMUST00000153921 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Ciart-201ENSMUST00000036418 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Tmem41b-203ENSMUST00000119929 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm43593-201ENSMUST00000198605 1346 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm13670-201ENSMUST00000120947 461 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Fhad1os1-201ENSMUST00000146094 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm5409-201ENSMUST00000160346 698 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Gm3261-201ENSMUST00000166886 481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 Zfp87-203ENSMUST00000181573 382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2bQ01097 AC154589.1-201ENSMUST00000228694 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms