Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 AC104200.1-201ENSMUST00000224527 1746 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Ccna1-201ENSMUST00000029368 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm7356-201ENSMUST00000186636 1527 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm7358-201ENSMUST00000189454 1527 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm28857-201ENSMUST00000188068 425 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Nctc1-202ENSMUST00000132167 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm2897-201ENSMUST00000166494 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm3411-201ENSMUST00000170104 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Zfp131-203ENSMUST00000223722 3109 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm36426-201ENSMUST00000222903 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Vma21-202ENSMUST00000114576 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
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Pou4f1P17208 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms