Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Nctc1-202ENSMUST00000132167 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Trim13-202ENSMUST00000165015 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 4930533K18Rik-201ENSMUST00000058942 1259 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm14164-202ENSMUST00000128577 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm45330-201ENSMUST00000209681 1575 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbdsP70122 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Cdh8-205ENSMUST00000142475 3216 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm44070-201ENSMUST00000203389 2220 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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