Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gabpa-202ENSMUST00000114184 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Syncrip-211ENSMUST00000174688 3176 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Baiap3-204ENSMUST00000182435 3758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Phactr1-205ENSMUST00000128646 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm18289-201ENSMUST00000203356 2989 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Csf1r-201ENSMUST00000025523 3870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Arhgef3-201ENSMUST00000049206 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Plekho2-201ENSMUST00000068944 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Echdc3-201ENSMUST00000042658 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm37459-201ENSMUST00000192259 2840 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Zfp469-202ENSMUST00000187142 3082 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms