Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Sms-201ENSMUST00000112529 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Gsdme-203ENSMUST00000165099 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms