Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ces2c-201ENSMUST00000055052 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zswim3-201ENSMUST00000052107 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Adcy9-202ENSMUST00000117801 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Sez6l2-202ENSMUST00000106333 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Snx25-201ENSMUST00000041582 3206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Grk2-201ENSMUST00000025791 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mep1a-201ENSMUST00000024707 2921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm10538-201ENSMUST00000189499 1877 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ctcflos-204ENSMUST00000153523 3476 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Chat-201ENSMUST00000070125 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Snx32-201ENSMUST00000070172 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Olfr1312-202ENSMUST00000213582 2891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm28447-202ENSMUST00000186677 2230 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms