Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Loxhd1-201ENSMUST00000035501 3814 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Tia1-202ENSMUST00000095753 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Itga9-202ENSMUST00000124360 1935 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm12154-201ENSMUST00000145584 445 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm9946-201ENSMUST00000008011 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Drc3-203ENSMUST00000108722 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ica1l-205ENSMUST00000189776 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Lrrc14b-201ENSMUST00000022064 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm4926-201ENSMUST00000132691 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm44815-201ENSMUST00000206812 1633 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Mir8113-201ENSMUST00000184956 129 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm30873-201ENSMUST00000207512 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms