Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5114W4VSN8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms