Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms