Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms