Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip2Q9Z0H8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms