Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnip1Q9WUU8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms