Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms