Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav3Q9R0C8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav3Q9R0C8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms