Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms