Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn8Q9QZ49 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms