Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms